Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTAN1Q13813 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms