Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOFQ13790 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOFQ13790 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOFQ13790 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOFQ13790 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOFQ13790 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOFQ13790 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOFQ13790 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOFQ13790 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOFQ13790 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOFQ13790 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOFQ13790 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOFQ13790 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOFQ13790 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOFQ13790 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOFQ13790 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOFQ13790 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOFQ13790 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOFQ13790 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOFQ13790 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOFQ13790 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOFQ13790 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOFQ13790 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOFQ13790 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOFQ13790 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
APOFQ13790 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
APOFQ13790 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOFQ13790 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOFQ13790 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOFQ13790 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOFQ13790 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOFQ13790 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOFQ13790 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOFQ13790 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOFQ13790 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOFQ13790 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOFQ13790 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOFQ13790 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOFQ13790 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOFQ13790 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOFQ13790 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOFQ13790 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOFQ13790 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOFQ13790 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOFQ13790 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOFQ13790 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOFQ13790 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOFQ13790 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOFQ13790 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOFQ13790 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOFQ13790 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOFQ13790 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOFQ13790 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOFQ13790 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOFQ13790 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOFQ13790 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOFQ13790 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOFQ13790 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOFQ13790 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOFQ13790 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOFQ13790 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOFQ13790 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOFQ13790 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOFQ13790 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOFQ13790 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOFQ13790 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOFQ13790 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOFQ13790 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOFQ13790 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOFQ13790 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOFQ13790 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOFQ13790 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOFQ13790 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOFQ13790 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOFQ13790 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOFQ13790 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOFQ13790 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOFQ13790 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOFQ13790 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOFQ13790 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOFQ13790 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOFQ13790 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOFQ13790 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOFQ13790 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOFQ13790 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOFQ13790 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOFQ13790 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOFQ13790 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOFQ13790 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOFQ13790 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
APOFQ13790 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOFQ13790 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOFQ13790 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOFQ13790 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOFQ13790 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOFQ13790 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOFQ13790 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOFQ13790 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
APOFQ13790 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOFQ13790 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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