Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCOA4Q13772 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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