Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMB3Q13751 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMB3Q13751 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMB3Q13751 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMB3Q13751 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMB3Q13751 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMB3Q13751 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMB3Q13751 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMB3Q13751 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMB3Q13751 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMB3Q13751 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMB3Q13751 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMB3Q13751 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMB3Q13751 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMB3Q13751 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMB3Q13751 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMB3Q13751 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMB3Q13751 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMB3Q13751 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMB3Q13751 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMB3Q13751 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMB3Q13751 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMB3Q13751 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMB3Q13751 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMB3Q13751 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMB3Q13751 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms