Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH18Q13634 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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