Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCIRG1Q13488 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCIRG1Q13488 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms