Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CLN3-263ENST00000637871 1606 ntTSL 520.41■□□□□ 0.863e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 FBXL19-209ENST00000566320 546 ntTSL 520.4■□□□□ 0.863e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.833e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.833e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLEC2L-202ENST00000520413 2190 ntTSL 220.22■□□□□ 0.833e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 SH2D2A-205ENST00000486350 781 ntTSL 320.17■□□□□ 0.823e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 AC138894.1-211ENST00000636766 2061 ntTSL 520.14■□□□□ 0.813e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 SELENOM-205ENST00000465536 703 ntTSL 220.06■□□□□ 0.82e-11■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.793e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-256ENST00000637107 1946 ntTSL 519.86■□□□□ 0.773e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.753e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 SH2D2A-204ENST00000468744 699 ntTSL 219.68■□□□□ 0.743e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 AC020915.1-203ENST00000610038 669 ntAPPRIS P5 TSL 519.63■□□□□ 0.733e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.733e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.73e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 AC138894.1-209ENST00000637299 1954 ntTSL 519.13■□□□□ 0.653e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.633e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.633e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.623e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-252ENST00000636907 1679 ntTSL 218.89■□□□□ 0.613e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.613e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 AC138894.1-208ENST00000636017 2223 ntTSL 518.78■□□□□ 0.63e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 AC138894.1-207ENST00000636866 2452 ntTSL 518.71■□□□□ 0.583e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.583e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.563e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.553e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.542e-11■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 AC138894.1-202ENST00000637376 2512 ntTSL 518.38■□□□□ 0.533e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.513e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.53e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.51e-21■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.482e-11■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 AC020915.1-206ENST00000609864 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.91■□□□□ 0.463e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.453e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 TBC1D17-208ENST00000600354 1547 ntTSL 217.62■□□□□ 0.413e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 AC138894.1-203ENST00000636078 2382 ntTSL 517.53■□□□□ 0.43e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.393e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 SERTAD3-205ENST00000601217 398 ntTSL 317.44■□□□□ 0.381e-6■■■■□ 26.6
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PABPC4Q13310 AC020915.1-205ENST00000608070 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.26■□□□□ 0.353e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.352e-11■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 AC138894.1-204ENST00000636503 2521 ntTSL 517.14■□□□□ 0.333e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.331e-21■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 MIR4458HG-201ENST00000502001 1005 ntTSL 1 (best)16.97■□□□□ 0.313e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.283e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CENPT-234ENST00000574569 897 ntTSL 216.76■□□□□ 0.272e-11■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.273e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.273e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CENPT-218ENST00000565157 2133 ntTSL 216.65■□□□□ 0.262e-11■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 DNAAF3-217ENST00000588076 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.59■□□□□ 0.253e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.243e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.223e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.223e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-253ENST00000636977 2969 ntTSL 516.4■□□□□ 0.223e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.213e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 AC138894.1-212ENST00000637745 879 ntTSL 516.29■□□□□ 0.23e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.193e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-242ENST00000635958 1837 ntTSL 516.17■□□□□ 0.183e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.153e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.123e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.053e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CEP250-204ENST00000422671 2648 ntTSL 515.33■□□□□ 0.043e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.013e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 ZW10-202ENST00000535142 2735 ntTSL 214.94□□□□□ -0.023e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CENPT-227ENST00000568495 1098 ntTSL 514.71□□□□□ -0.052e-11■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 VAMP7-201ENST00000262640 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.063e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 BLM-210ENST00000560821 1024 ntTSL 214.64□□□□□ -0.073e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 SERTAD3-202ENST00000392028 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.081e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-210ENST00000563874 3081 ntTSL 214.44□□□□□ -0.13e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.123e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 STRN4-219ENST00000600615 788 ntTSL 214.3□□□□□ -0.123e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CENPT-233ENST00000569862 2957 ntTSL 214.24□□□□□ -0.132e-11■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.153e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.163e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.233e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 USF1-203ENST00000368021 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.233e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CD99-209ENST00000497752 806 ntTSL 213.24□□□□□ -0.293e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 DNAAF3-216ENST00000587789 1020 ntTSL 513.24□□□□□ -0.293e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 AC138894.1-210ENST00000638036 1154 ntTSL 513.17□□□□□ -0.33e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 ZWILCH-202ENST00000446801 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.353e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-238ENST00000569430 3867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.423e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLN3-244ENST00000636147 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.483e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 ZWILCH-214ENST00000613446 3181 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.513e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 OXCT1-201ENST00000196371 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.513e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 HPS5-203ENST00000396253 4725 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.542e-7■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 SELENOF-205ENST00000469566 831 ntTSL 211.52□□□□□ -0.573e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 TMEM173-207ENST00000509573 987 ntTSL 311.43□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 PITPNM1-209ENST00000527370 3712 ntTSL 211.38□□□□□ -0.593e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 CLEC16A-201ENST00000261657 4351 ntTSL 411.15□□□□□ -0.623e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 SMIM19-204ENST00000438528 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.633e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 USF1-204ENST00000472217 1097 ntTSL 210.92□□□□□ -0.663e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 BLM-203ENST00000558825 1683 ntTSL 510.85□□□□□ -0.673e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 MIR4458HG-203ENST00000606459 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.723e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 AC132217.1-201ENST00000430034 373 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.733e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 AC138894.1-205ENST00000637378 1112 ntAPPRIS P1 TSL 510.37□□□□□ -0.753e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 ZWILCH-201ENST00000307897 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.763e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 ARID2-201ENST00000334344 8642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.773e-6■■■■□ 26.6
PABPC4Q13310 HPS5-201ENST00000349215 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.892e-7■■■■□ 26.6
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