Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RESTQ13127 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RESTQ13127 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RESTQ13127 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RESTQ13127 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RESTQ13127 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RESTQ13127 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RESTQ13127 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RESTQ13127 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RESTQ13127 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RESTQ13127 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RESTQ13127 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RESTQ13127 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RESTQ13127 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RESTQ13127 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RESTQ13127 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RESTQ13127 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RESTQ13127 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RESTQ13127 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RESTQ13127 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RESTQ13127 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RESTQ13127 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RESTQ13127 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RESTQ13127 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RESTQ13127 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RESTQ13127 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RESTQ13127 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RESTQ13127 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RESTQ13127 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RESTQ13127 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RESTQ13127 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RESTQ13127 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RESTQ13127 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RESTQ13127 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RESTQ13127 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RESTQ13127 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RESTQ13127 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RESTQ13127 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RESTQ13127 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RESTQ13127 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RESTQ13127 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RESTQ13127 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RESTQ13127 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RESTQ13127 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RESTQ13127 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RESTQ13127 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RESTQ13127 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RESTQ13127 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RESTQ13127 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RESTQ13127 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RESTQ13127 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RESTQ13127 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RESTQ13127 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RESTQ13127 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RESTQ13127 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RESTQ13127 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RESTQ13127 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RESTQ13127 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RESTQ13127 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RESTQ13127 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RESTQ13127 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RESTQ13127 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RESTQ13127 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RESTQ13127 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RESTQ13127 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RESTQ13127 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RESTQ13127 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RESTQ13127 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RESTQ13127 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RESTQ13127 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RESTQ13127 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RESTQ13127 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RESTQ13127 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RESTQ13127 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RESTQ13127 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RESTQ13127 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RESTQ13127 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RESTQ13127 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RESTQ13127 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RESTQ13127 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RESTQ13127 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RESTQ13127 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RESTQ13127 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RESTQ13127 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RESTQ13127 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RESTQ13127 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RESTQ13127 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RESTQ13127 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RESTQ13127 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RESTQ13127 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RESTQ13127 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RESTQ13127 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RESTQ13127 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RESTQ13127 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RESTQ13127 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RESTQ13127 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RESTQ13127 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RESTQ13127 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RESTQ13127 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RESTQ13127 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms