Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPS1Q13098 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPS1Q13098 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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