Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNIP1Q12981 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms