Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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FOXD4Q12950 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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FOXD4Q12950 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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FOXD4Q12950 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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FOXD4Q12950 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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FOXD4Q12950 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXD4Q12950 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
FOXD4Q12950 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
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