Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXF1Q12946 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXF1Q12946 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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