Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAPQ12770 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms