Protein–RNA interactions for Protein: Q12042

YPL162C, Vacuolar membrane protein YPL162C, yeastyeast

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL162CQ12042 YKR078WYKR078W 1758 nt2.21□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 RRP14YKL082C 1305 nt2.2□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 YME2YMR302C 2553 nt2.2□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 KEG1YFR042W 603 nt2.2□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 PRP18YGR006W 756 nt2.2□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 RGI2YIL057C 495 nt2.2□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 MTD1YKR080W 963 nt2.2□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 POP8YBL018C 402 nt2.2□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 SPO20YMR017W 1194 nt2.2□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 SUB1YMR039C 879 nt2.2□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 MRPL16YBL038W 699 nt2.2□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 UTP14YML093W 2700 nt2.2□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 RTT10YPL183C 3042 nt2.2□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 CWC22YGR278W 1734 nt2.2□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 RPO41YFL036W 4056 nt2.19□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 PSD2YGR170W 3417 nt2.19□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 VPS30YPL120W 1674 nt2.19□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 KEL2YGR238C 2649 nt2.19□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 RMD5YDR255C 1266 nt2.19□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 RPL23BYER117W 414 nt2.19□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 NNT1YLR285W 786 nt2.19□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 YOL114CYOL114C 609 nt2.19□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 YOR203WYOR203W 354 nt2.19□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 MCT1YOR221C 1083 nt2.19□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 YOR387CYOR387C 621 nt2.19□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 LTP1YPR073C 486 nt2.19□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 AVT5YBL089W 1380 nt2.19□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 GEA1YJR031C 4227 nt2.19□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 MSH4YFL003C 2637 nt2.19□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 HMO1YDR174W 741 nt2.18□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 YDR491CYDR491C 492 nt2.18□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 YGL159WYGL159W 1113 nt2.18□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.18□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 MTM1YGR257C 1101 nt2.18□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 RPL17BYJL177W 555 nt2.18□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 TFA2YKR062W 987 nt2.18□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 YLR365WYLR365W 333 nt2.18□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 MPP6YNR024W 561 nt2.18□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 POS5YPL188W 1245 nt2.18□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 TIM12YBR091C 330 nt2.18□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 FAA2YER015W 2235 nt2.18□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 AXL1YPR122W 3627 nt2.17□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 YDR535CYDR535C 501 nt2.17□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.17□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 MST27YGL051W 705 nt2.17□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 ATG27YJL178C 816 nt2.17□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 ARC19YKL013C 516 nt2.17□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 YLR012CYLR012C 300 nt2.17□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 ILV5YLR355C 1188 nt2.17□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 YMR087WYMR087W 855 nt2.17□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 YMR178WYMR178W 825 nt2.17□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 MRPL33YMR286W 261 nt2.17□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 YOL024WYOL024W 519 nt2.17□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 INO4YOL108C 456 nt2.17□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt2.17□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 LDH1YBR204C 1128 nt2.17□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 STN1YDR082W 1485 nt2.17□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 AVT2YEL064C 1443 nt2.17□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 MRD1YPR112C 2664 nt2.16□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 SGS1YMR190C 4344 nt2.16□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 YDR239CYDR239C 2364 nt2.16□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 IRA2YOL081W 9240 nt2.16□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 FRE8YLR047C 2061 nt2.16□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 YBR259WYBR259W 2067 nt2.16□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 YDL241WYDL241W 372 nt2.16□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 HYP2YEL034W 474 nt2.16□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 AST2YER101C 1293 nt2.16□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 YIP5YGL161C 933 nt2.16□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 RPL24BYGR148C 468 nt2.16□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt2.16□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 BET5YML077W 480 nt2.16□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.16□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 EAF7YNL136W 1278 nt2.16□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 SRL1YOR247W 633 nt2.16□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 RRG7YOR305W 729 nt2.16□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 DPB3YBR278W 606 nt2.16□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 HBT1YDL223C 3141 nt2.16□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 ATP22YDR350C 2055 nt2.16□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 SLI1YGR212W 1407 nt2.16□□□□□ -2.06
YPL162CQ12042 POL4YCR014C 1749 nt2.15□□□□□ -2.07
YPL162CQ12042 COBQ0105 1158 nt2.15□□□□□ -2.07
YPL162CQ12042 ERP6YGL002W 651 nt2.15□□□□□ -2.07
YPL162CQ12042 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt2.15□□□□□ -2.07
YPL162CQ12042 PEF1YGR058W 1008 nt2.15□□□□□ -2.07
YPL162CQ12042 MMF1YIL051C 438 nt2.15□□□□□ -2.07
YPL162CQ12042 RPA12YJR063W 378 nt2.15□□□□□ -2.07
YPL162CQ12042 MCR1YKL150W 909 nt2.15□□□□□ -2.07
YPL162CQ12042 EBP2YKL172W 1284 nt2.15□□□□□ -2.07
YPL162CQ12042 CDC123YLR215C 1083 nt2.15□□□□□ -2.07
YPL162CQ12042 ERV41YML067C 1059 nt2.15□□□□□ -2.07
YPL162CQ12042 SAM37YMR060C 984 nt2.15□□□□□ -2.07
YPL162CQ12042 RUF20RUF20 443 nt2.15□□□□□ -2.07
YPL162CQ12042 DUG3YNL191W 1074 nt2.15□□□□□ -2.07
YPL162CQ12042 TPT1YOL102C 693 nt2.15□□□□□ -2.07
YPL162CQ12042 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.15□□□□□ -2.07
YPL162CQ12042 BOI1YBL085W 2943 nt2.14□□□□□ -2.07
YPL162CQ12042 MAK5YBR142W 2322 nt2.14□□□□□ -2.07
YPL162CQ12042 SLY41YOR307C 1362 nt2.14□□□□□ -2.07
YPL162CQ12042 IKI3YLR384C 4050 nt2.14□□□□□ -2.07
YPL162CQ12042 TCA17YEL048C 459 nt2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.8 ms