Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC173Q0VFZ6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms