Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM27E3Q08E93 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms