Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD300CQ08708 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD300CQ08708 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms