Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPOCK1Q08629 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK1Q08629 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms