Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN1BQ07699 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms