Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSME1Q06323 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PSME1Q06323 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSME1Q06323 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms