Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDSRQ06136 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDSRQ06136 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms