Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A2Q05940 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A2Q05940 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms