Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms