Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN1Q04323 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN1Q04323 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms