Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID5AQ03989 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID5AQ03989 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID5AQ03989 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID5AQ03989 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID5AQ03989 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID5AQ03989 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID5AQ03989 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID5AQ03989 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID5AQ03989 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID5AQ03989 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID5AQ03989 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID5AQ03989 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID5AQ03989 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID5AQ03989 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID5AQ03989 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID5AQ03989 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID5AQ03989 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID5AQ03989 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID5AQ03989 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID5AQ03989 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID5AQ03989 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID5AQ03989 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms