Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPCQ03188 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms