Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUCB1Q02818 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NUCB1Q02818 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms