Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DSG1Q02413 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG1Q02413 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms