Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A3Q01959 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms