Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
XPCQ01831 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
XPCQ01831 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
XPCQ01831 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
XPCQ01831 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
XPCQ01831 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
XPCQ01831 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
XPCQ01831 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
XPCQ01831 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
XPCQ01831 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
XPCQ01831 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
XPCQ01831 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
XPCQ01831 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
XPCQ01831 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
XPCQ01831 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
XPCQ01831 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
XPCQ01831 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
XPCQ01831 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
XPCQ01831 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
XPCQ01831 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
XPCQ01831 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
XPCQ01831 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
XPCQ01831 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
XPCQ01831 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
XPCQ01831 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
XPCQ01831 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
XPCQ01831 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
XPCQ01831 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
XPCQ01831 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
XPCQ01831 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
XPCQ01831 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
XPCQ01831 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
XPCQ01831 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
XPCQ01831 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
XPCQ01831 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
XPCQ01831 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
XPCQ01831 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
XPCQ01831 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
XPCQ01831 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
XPCQ01831 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
XPCQ01831 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
XPCQ01831 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
XPCQ01831 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
XPCQ01831 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
XPCQ01831 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
XPCQ01831 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
XPCQ01831 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
XPCQ01831 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
XPCQ01831 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
XPCQ01831 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
XPCQ01831 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
XPCQ01831 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
XPCQ01831 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
XPCQ01831 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
XPCQ01831 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
XPCQ01831 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
XPCQ01831 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
XPCQ01831 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
XPCQ01831 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
XPCQ01831 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
XPCQ01831 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
XPCQ01831 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
XPCQ01831 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
XPCQ01831 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
XPCQ01831 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
XPCQ01831 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
XPCQ01831 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
XPCQ01831 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
XPCQ01831 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
XPCQ01831 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
XPCQ01831 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
XPCQ01831 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
XPCQ01831 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
XPCQ01831 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
XPCQ01831 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
XPCQ01831 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
XPCQ01831 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
XPCQ01831 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
XPCQ01831 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
XPCQ01831 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
XPCQ01831 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
XPCQ01831 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
XPCQ01831 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
XPCQ01831 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
XPCQ01831 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
XPCQ01831 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
XPCQ01831 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
XPCQ01831 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
XPCQ01831 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
XPCQ01831 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
XPCQ01831 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
XPCQ01831 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
XPCQ01831 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
XPCQ01831 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
XPCQ01831 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
XPCQ01831 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
XPCQ01831 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
XPCQ01831 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
XPCQ01831 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
XPCQ01831 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms