Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1DQ01668 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1DQ01668 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms