Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A2Q01362 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A2Q01362 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms