Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HSF1Q00613 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms