Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
HOXC5Q00444 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXC5Q00444 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms