Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms