Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUMO1P63165 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO1P63165 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms