Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRPFP62306 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms