Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO4P61968 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO4P61968 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO4P61968 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO4P61968 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO4P61968 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO4P61968 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO4P61968 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO4P61968 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO4P61968 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO4P61968 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO4P61968 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO4P61968 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO4P61968 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO4P61968 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO4P61968 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO4P61968 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO4P61968 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO4P61968 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO4P61968 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO4P61968 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO4P61968 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO4P61968 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO4P61968 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO4P61968 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO4P61968 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO4P61968 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO4P61968 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO4P61968 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO4P61968 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO4P61968 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO4P61968 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO4P61968 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO4P61968 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO4P61968 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMO4P61968 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMO4P61968 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMO4P61968 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMO4P61968 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMO4P61968 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMO4P61968 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMO4P61968 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LMO4P61968 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMO4P61968 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMO4P61968 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMO4P61968 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LMO4P61968 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMO4P61968 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMO4P61968 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMO4P61968 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMO4P61968 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMO4P61968 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMO4P61968 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMO4P61968 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMO4P61968 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMO4P61968 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMO4P61968 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMO4P61968 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMO4P61968 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMO4P61968 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMO4P61968 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMO4P61968 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMO4P61968 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMO4P61968 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMO4P61968 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LMO4P61968 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMO4P61968 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMO4P61968 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMO4P61968 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMO4P61968 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMO4P61968 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMO4P61968 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMO4P61968 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMO4P61968 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMO4P61968 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMO4P61968 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO4P61968 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO4P61968 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO4P61968 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO4P61968 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO4P61968 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO4P61968 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO4P61968 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO4P61968 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO4P61968 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO4P61968 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO4P61968 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO4P61968 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO4P61968 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO4P61968 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO4P61968 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO4P61968 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO4P61968 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO4P61968 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO4P61968 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO4P61968 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO4P61968 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO4P61968 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO4P61968 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO4P61968 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms