Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVS71-1P61550 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVS71-1P61550 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms