Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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TMEM258P61165 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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TMEM258P61165 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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TMEM258P61165 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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TMEM258P61165 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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TMEM258P61165 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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TMEM258P61165 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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