Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00310P59036 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms