Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA9P57773 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA9P57773 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA9P57773 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA9P57773 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA9P57773 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA9P57773 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA9P57773 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA9P57773 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA9P57773 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA9P57773 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA9P57773 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA9P57773 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA9P57773 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA9P57773 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA9P57773 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA9P57773 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA9P57773 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA9P57773 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA9P57773 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA9P57773 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA9P57773 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA9P57773 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA9P57773 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA9P57773 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA9P57773 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA9P57773 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA9P57773 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA9P57773 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA9P57773 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA9P57773 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA9P57773 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA9P57773 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA9P57773 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA9P57773 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA9P57773 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA9P57773 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA9P57773 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA9P57773 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA9P57773 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA9P57773 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA9P57773 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA9P57773 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA9P57773 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA9P57773 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA9P57773 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA9P57773 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA9P57773 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA9P57773 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA9P57773 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA9P57773 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA9P57773 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA9P57773 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA9P57773 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA9P57773 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA9P57773 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA9P57773 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA9P57773 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJA9P57773 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA9P57773 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA9P57773 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA9P57773 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA9P57773 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA9P57773 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA9P57773 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA9P57773 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA9P57773 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA9P57773 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA9P57773 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA9P57773 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA9P57773 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA9P57773 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA9P57773 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA9P57773 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA9P57773 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA9P57773 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA9P57773 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA9P57773 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA9P57773 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA9P57773 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA9P57773 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA9P57773 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA9P57773 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA9P57773 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA9P57773 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA9P57773 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA9P57773 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA9P57773 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA9P57773 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA9P57773 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA9P57773 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA9P57773 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA9P57773 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA9P57773 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA9P57773 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA9P57773 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA9P57773 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA9P57773 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA9P57773 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA9P57773 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms