Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBASH3AP57075 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBASH3AP57075 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms