Protein–RNA interactions for Protein: P55083

MFAP4, Microfibril-associated glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP4P55083 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MFAP4P55083 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MFAP4P55083 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MFAP4P55083 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MFAP4P55083 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MFAP4P55083 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MFAP4P55083 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MFAP4P55083 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MFAP4P55083 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MFAP4P55083 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MFAP4P55083 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MFAP4P55083 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MFAP4P55083 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MFAP4P55083 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MFAP4P55083 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MFAP4P55083 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MFAP4P55083 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MFAP4P55083 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MFAP4P55083 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MFAP4P55083 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MFAP4P55083 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms