Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFAP3P55082 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms