Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAD23AP54725 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms