Protein–RNA interactions for Protein: P50416

CPT1A, Carnitine O-palmitoyltransferase 1, liver isoform, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPT1AP50416 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPT1AP50416 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPT1AP50416 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms