Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLMP48507 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLMP48507 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLMP48507 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLMP48507 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLMP48507 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLMP48507 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLMP48507 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLMP48507 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLMP48507 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLMP48507 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLMP48507 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLMP48507 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLMP48507 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLMP48507 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLMP48507 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLMP48507 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLMP48507 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLMP48507 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLMP48507 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLMP48507 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLMP48507 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLMP48507 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLMP48507 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLMP48507 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLMP48507 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLMP48507 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCLMP48507 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLMP48507 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLMP48507 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLMP48507 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLMP48507 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLMP48507 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLMP48507 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLMP48507 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLMP48507 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLMP48507 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLMP48507 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLMP48507 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLMP48507 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLMP48507 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLMP48507 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLMP48507 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCLMP48507 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLMP48507 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLMP48507 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLMP48507 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLMP48507 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLMP48507 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLMP48507 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLMP48507 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLMP48507 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLMP48507 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLMP48507 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLMP48507 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLMP48507 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLMP48507 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLMP48507 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLMP48507 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLMP48507 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCLMP48507 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLMP48507 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLMP48507 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLMP48507 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLMP48507 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLMP48507 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLMP48507 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLMP48507 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLMP48507 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLMP48507 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLMP48507 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLMP48507 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLMP48507 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLMP48507 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLMP48507 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLMP48507 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLMP48507 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCLMP48507 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLMP48507 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLMP48507 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLMP48507 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLMP48507 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLMP48507 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLMP48507 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLMP48507 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLMP48507 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLMP48507 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLMP48507 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLMP48507 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLMP48507 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLMP48507 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCLMP48507 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLMP48507 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLMP48507 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLMP48507 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLMP48507 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLMP48507 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLMP48507 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLMP48507 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLMP48507 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms