Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP5P45974 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP5P45974 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP5P45974 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP5P45974 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP5P45974 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP5P45974 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP5P45974 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP5P45974 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP5P45974 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP5P45974 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP5P45974 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP5P45974 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP5P45974 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP5P45974 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP5P45974 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP5P45974 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP5P45974 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP5P45974 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP5P45974 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP5P45974 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP5P45974 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP5P45974 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP5P45974 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP5P45974 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP5P45974 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP5P45974 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP5P45974 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP5P45974 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP5P45974 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP5P45974 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP5P45974 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP5P45974 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP5P45974 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP5P45974 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP5P45974 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP5P45974 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP5P45974 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP5P45974 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP5P45974 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP5P45974 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP5P45974 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP5P45974 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP5P45974 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP5P45974 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP5P45974 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP5P45974 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP5P45974 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP5P45974 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP5P45974 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP5P45974 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP5P45974 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP5P45974 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP5P45974 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP5P45974 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP5P45974 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP5P45974 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP5P45974 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP5P45974 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP5P45974 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP5P45974 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP5P45974 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP5P45974 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP5P45974 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP5P45974 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP5P45974 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP5P45974 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP5P45974 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP5P45974 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP5P45974 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP5P45974 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP5P45974 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP5P45974 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP5P45974 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP5P45974 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP5P45974 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP5P45974 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP5P45974 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP5P45974 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP5P45974 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP5P45974 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP5P45974 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP5P45974 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP5P45974 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP5P45974 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP5P45974 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP5P45974 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP5P45974 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP5P45974 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP5P45974 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP5P45974 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP5P45974 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP5P45974 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP5P45974 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP5P45974 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP5P45974 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP5P45974 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP5P45974 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP5P45974 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP5P45974 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms