Protein–RNA interactions for Protein: P43601

ATG18, Autophagy-related protein 18, yeastyeast

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG18P43601 ATG26YLR189C 3597 nt2.76□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YBP2YGL060W 1926 nt2.76□□□□□ -1.97
ATG18P43601 SYT1YPR095C 3681 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG18P43601 ERG11YHR007C 1593 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG18P43601 ERG9YHR190W 1335 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG18P43601 CLB3YDL155W 1284 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YDR149CYDR149C 708 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG18P43601 RPS28BYLR264W 204 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG18P43601 FAR3YMR052W 615 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG18P43601 OCA2YNL056W 594 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG18P43601 POP7YBR167C 423 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG18P43601 TFC4YGR047C 3078 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG18P43601 IRC3YDR332W 2070 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG18P43601 SRP1YNL189W 1629 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG18P43601 CEP3YMR168C 1827 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG18P43601 FLO5YHR211W 3228 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG18P43601 DUN1YDL101C 1542 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG18P43601 BEM4YPL161C 1902 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG18P43601 APC5YOR249C 2058 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG18P43601 SEC7YDR170C 6030 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG18P43601 NUR1YDL089W 1455 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG18P43601 snR68snR68 136 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG18P43601 BSC1YDL037C 987 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG18P43601 UBC13YDR092W 462 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YHR054CYHR054C 1065 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YJL114WYJL114W 681 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG18P43601 ATG10YLL042C 504 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG18P43601 UNG1YML021C 1080 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG18P43601 TSR4YOL022C 1227 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YBR063CYBR063C 1215 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG18P43601 BPT1YLL015W 4680 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG18P43601 NMD2YHR077C 3270 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG18P43601 CDC37YDR168W 1521 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG18P43601 TRM82YDR165W 1335 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YMR046CYMR046C 1323 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG18P43601 RAD18YCR066W 1464 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG18P43601 GIS4YML006C 2325 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG18P43601 TOP1YOL006C 2310 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG18P43601 SPT2YER161C 1002 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG18P43601 PGD1YGL025C 1194 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YGL109WYGL109W 324 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YGR039WYGR039W 312 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG18P43601 GOS1YHL031C 672 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YKL123WYKL123W 381 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YLR297WYLR297W 390 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG18P43601 ERG2YMR202W 669 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YOR152CYOR152C 771 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG18P43601 snR24snR24 89 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG18P43601 ETP1YHL010C 1758 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG18P43601 AEP1YMR064W 1557 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG18P43601 FLO1YAR050W 4614 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG18P43601 NOP56YLR197W 1515 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG18P43601 HMO1YDR174W 741 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YDR248CYDR248C 582 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YFH7YFR007W 1062 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG18P43601 RRM3YHR031C 2172 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG18P43601 LIN1YHR156C 1023 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG18P43601 AIM19YIL087C 474 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG18P43601 CAP1YKL007W 807 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YKL091CYKL091C 933 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG18P43601 TPO5YKL174C 1857 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YPT52YKR014C 705 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YNR025CYNR025C 360 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG18P43601 DGA1YOR245C 1257 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG18P43601 SRL1YOR247W 633 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG18P43601 CCM1YGR150C 2595 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG18P43601 ESL1YIL151C 3357 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG18P43601 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 UBP5YER144C 2418 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 ARG2YJL071W 1725 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 LRG1YDL240W 3054 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 INP52YNL106C 3552 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 DBP7YKR024C 2229 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 NRG1YDR043C 696 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 DYN2YDR424C 279 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 SMT3YDR510W 306 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 PAU13YHL046C 363 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 ATP11YNL315C 957 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 HHF1YBR009C 312 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 RIF1YBR275C 5751 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 REF2YDR195W 1602 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 AKR1YDR264C 2295 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 ARP5YNL059C 2268 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG18P43601 TOM1YDR457W 9807 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG18P43601 SEC15YGL233W 2733 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG18P43601 ECM29YHL030W 5607 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG18P43601 TCP1YDR212W 1680 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG18P43601 HRD1YOL013C 1656 nt2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.6 ms